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Stage Bac +5 - Data Science - Apprentissage fédéré - F/H

This job posting is no longer active.

Location: Marcy l'Etoile, France
Position Type: Trainee/Intern
Job Function: Bioscience R&D

A family-owned company, bioMérieux has grown to become a world leader in the field of in vitro diagnostics. For almost 60 years and across the world, we have imagined and developed innovative diagnostics solutions to improve public health. Today, our teams are spread across 45 countries and serve 160 countries with the support of a large distribution network.
Come and join a family-owned global company with a long-term vision, and a human-centered culture.

 

 

 

Quelle est votre mission chez bioMérieux?

En permettant de mutualiser des jeux de données tout en respectant les contraintes de confidentialité liées aux données patient, les techniques d'apprentissage fédéré offrent de nouvelles perspectives pour la construction de modèles de prédiction dans le domaine de la santé.

L'objectif de ce stage est d'évaluer l'intérêt de ces approches dans le domaine de la microbiologie clinique, pour l'analyse de la résistance aux antibiotiques.

Après un état de l'art des différentes méthodes existantes et des différents outils disponibles, deux axes seront étudiés :

  • un axe descriptif visant à mettre en place un prototype de suivi spatial des niveaux de résistance aux antibiotiques.
  • un axe prédictif ayant pour objectif de construire des modèles de prédiction de la résistance aux antibiotiques sur la base de génomes complets.

 

Pour la mise en place de ce type d’approches, vous pourrez notamment vous appuyer sur les librairies (Scikit-learn, TensorFlow, Keras, …) et aurez accès à la grille de calcul de bioMérieux.

Mots-clés

Federated learning  ; Dashboard interactif ; résistance bactérienne.

 

Qui êtes-vous?

  • Vous préparez un Master 2 ou vous êtes en dernière année d’école d’ingénieur, avec une spécialisation en Data science ou en mathématiques appliquées.
  • Vous avez un bagage théorique dans le domaine de l’apprentissage statistique et expérience dans sa mise en œuvre (en Python).
  • Vous avez une première expérience avec les outils de visualisation interactive des données (dash, plotly) serait fortement appréciée.
  • Vous faites preuve d'agilité dans un environnement Linux et vous avez des familiarités avec les langages de scripts (e.g., shell, Python).
  • Vous faites preuve d'autonomie, de rigueur et de curiosité scientifique.
  • Vous avez un sens de la communication écrite et orale.
  • Vous avez la capacité de lire des publications scientifiques écrites en anglais.
  • Des connaissances en biologie seraient appréciées mais ne sont pas requises.

bioMérieux welcomes applications from all individuals, regardless of race, national origin, gender, age, physical characteristics, social origin, disability, union membership, religion, family status, pregnancy, sexual orientation, gender identity, gender expression or any unlawful criterion under applicable law. We are committed to treating all applicants fairly and avoiding discrimination.

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