Stage Bac +5 - Data Science - Interprétabilité des modèles de machine learning - F/H

A family-owned company, bioMérieux has grown to become a world leader in the field of in vitro diagnostics. For almost 60 years and across the world, we have imagined and developed innovative diagnostics solutions to improve public health. Today, our teams are spread across 45 countries and serve 160 countries with the support of a large distribution network.
Come and join a family-owned global company with a long-term vision, and a human-centered culture.

Quelle est votre mission chez bioMérieux?

La résistance aux antimicrobiens est un enjeu majeur de santé publique qui est au cœur de la stratégie de bioMérieux. La résistance bactérienne intervient en réponse à une mauvaise utilisation ou dosage des antibiotiques. Elle se manifeste par le développent de mécanisme de résistance via la mutation d’un gène existant dans le génome de la bactérie ou via l’acquisition de nouveaux gènes.  

Au sein du département Data Science, nous travaillons sur le développement de solutions de diagnostic innovantes, basées sur les technologies de séquençage haut débit pour adresser cette problématique par des algorithmes d’apprentissage automatique.

L’objectif de ce stage est de travailler dans un premier temps sur l’amélioration de la calibration des modèles d’apprentissage. Dans un deuxième temps, on s’intéressera à l’interprétation des modèles.

Pour la mise en place de ce type d’approches, vous pourrez notamment vous appuyer sur les librairies (Scikit-learn, Keras, …) et aurez accès à la grille de calcul de bioMérieux.

Mots-clés

Apprentissage automatique ; calibration des modèles ; interprétation ; génomique bactérienne ; résistance bactérienne.

Qui êtes-vous?

• Vous préparez un Master 2 ou vous êtes en dernière année d’école d’ingénieur, avec une spécialisation en Data science ou en mathématiques appliquées.
• Vous avez un bagage théorique dans le domaine de l’apprentissage statistique et expérience dans sa mise en œuvre (en Python).
• Vous avez une première expérience avec les outils de visualisation interactive des données (dash, plotly) serait fortement appréciée.
• Vous faites preuve d'agilité dans un environnement Linux et vous avez des familiarités avec les langages de scripts (e.g., shell, Python).
• Vous faites preuve d'autonomie, de rigueur et de curiosité scientifique.
• Vous avez un sens de la communication écrite et orale.
• Vous avez la capacité de lire des publications scientifiques écrites en anglais.
• Des connaissances en biologie seraient appréciées mais ne sont pas requises.

Ce stage peut être basé à Marcy L'Etoile (69280) ou à Grenoble (38000)

bioMérieux welcomes applications from all individuals, regardless of race, national origin, gender, age, physical characteristics, social origin, disability, union membership, religion, family status, pregnancy, sexual orientation, gender identity, gender expression or any unlawful criterion under applicable law. We are committed to treating all applicants fairly and avoiding discrimination.