Stage Bac +5 - Data Science - Machine learning workflow - F/H

A family-owned company, bioMérieux has grown to become a world leader in the field of in vitro diagnostics. For almost 60 years and across the world, we have imagined and developed innovative diagnostics solutions to improve public health. Today, our teams are spread across 45 countries and serve 160 countries with the support of a large distribution network.
Come and join a family-owned global company with a long-term vision, and a human-centered culture.

Quelle est votre mission chez bioMérieux?

La résistance aux antimicrobiens est un enjeu majeur de santé publique qui est au cœur de la stratégie de bioMérieux. La résistance bactérienne intervient en réponse à une mauvaise utilisation ou dosage des antibiotiques. Elle se manifeste par le développement de mécanismes de résistance via la mutation d’un gène existant dans le génome de la bactérie ou via l’acquisition de nouveaux gènes.  

Au sein du département Data Science, nous travaillons sur le développement de solutions de diagnostic innovantes, basées sur les technologies de séquençage haut débit pour adresser cette problématique par des algorithmes d’apprentissage automatique.

Etant confrontés à une forte volumétrie de données et dans un contexte HPC, nous avons déployé une partie de nos pipelines d’apprentissage automatique sur le cloud.

L’objectif de ce stage est de participer à l’amélioration de ces solutions (standardisation & optimisation des fonctions, parallélisation des apprentissages, monitoring des exécutions et apprentissages, dimensionnement automatique des jobs) ainsi qu’à les étendre (preprocessing, CI, infra-as-code, …).

Mots-clés

AWS; Docker ; intégration continue; Python ; apprentissage automatique; génomique bactérienne 

Qui êtes-vous?

• Vous préparez actuellement un Master 2 ou vous êtes en dernière année d’école d’ingénieur, avec une spécialisation en Informatique,
• Vous faites preuve d'agilité dans un environnement Linux et êtes familier avec les langages de scripts (e.g., shell, Python, R),
• Vous connaissez l'industrialisation de solutions informatiques (notamment cloud),
• Vous êtes familier avec le domaine de l’apprentissage statistique,
• Vous faites preuve d'autonomie, de rigueur et d'une curiosité scientifique,
• Votre niveau d'anglais, vous permet d'être à l'aise à l'écrit comme à l'oral.
• Des connaissances en biologie seraient appréciées mais ne sont pas requises.

bioMérieux welcomes applications from all individuals, regardless of race, national origin, gender, age, physical characteristics, social origin, disability, union membership, religion, family status, pregnancy, sexual orientation, gender identity, gender expression or any unlawful criterion under applicable law. We are committed to treating all applicants fairly and avoiding discrimination.